2021). Dans une étude plus récente

La distribution des mesures de MBC dans cette étude a confirmé les résultats de l'étude précédente en décrivant une distribution normale du phénotype de MBC, avec 5% de chute de deux écarts-types au-dessus de la moyenne (Gallagher et al. 2003). Dans cette étude précédente, la moyenne était de 4,05 cM, tandis que la moyenne trouvée dans cette étude était plus petite, 3,6 cM. Les différences d'âge des chevaux peuvent expliquer cette différence, car l'étude précédente a montré une corrélation positive pour l'âge et le MBC ; l'âge moyen dans la première étude était de 7,8 ans et l'âge moyen dans cette étude était de 7,1 ans.

L'étude WGA a démontré la présence d'un gène récessif responsable du caractère swayback chez les chevaux. Cela a été suggéré dans l'étude WGA initiale avec 40 chevaux et la puce Illumina SNP (P corrigé = 0,017). L'association a été confirmée dans une étude ultérieure avec un deuxième groupe de chevaux affectés utilisant des SNP de cette zone ciblée (P = 0,036). En utilisant les données de tous les chevaux, un haplotype montrant la plus forte association avec le swayback a été identifié sur la base de quatre SNP (TGTG) décrits dans le tableau 3. Cet haplotype couvrait 1 073 074 bases et la région abritait 53 gènes connus et prédits.

L'haplotype TGTG était le plus courant et suggère que l'haplotype s'est produit dans la race avant la mutation causant le recul. Si un gène présent dans cet haplotype était muté pour provoquer un swayback, alors seule la connaissance de la mutation spécifique nous permettrait de faire la distinction entre ces haplotypes. Bien sûr, les mutations qui se sont produites par la suite au sein de l'haplotype responsable du swayback pourraient nous permettre d'utiliser des tests pour d'autres marqueurs afin d'identifier les haplotypes complètement associés au swayback, bien que tous les chevaux ne possèdent pas ce gène du swayback.

La fréquence élevée de cet haplotype et de ce phénotype chez les chevaux ASB pourrait être la conséquence d'une sélection par les éleveurs. Si une seule copie du gène produisait un effet phénotypique souhaitable, tel qu'une démarche améliorée, la sélection pour ce trait peut annuler la sélection contre le recul et entraîner une augmentation nette de la fréquence du gène dans la race. Des comparaisons des fréquences des gènes pour l'haplotype TGTG chez des chevaux avec différents phénotypes de performance sont nécessaires pour répondre à cette question.

Alors que la forte homozygotie de cet haplotype parmi les chevaux swayback a démontré la présence d'un gène récessif pour le trait, tous les chevaux swayback n'étaient pas homozygotes pour la région. Nous avons trouvé cinq haplotypes différents parmi les chevaux swayback, et 30 % n'étaient pas homozygotes pour l'haplotype associé à la condition swayback récessive. Le phénotype swayback peut avoir plusieurs causes possibles, dont la condition héréditaire récessive n'est qu'une. Alors que 70 % des chevaux swayback étaient homozygotes pour cet haplotype, nous avons observé sept (21 %) chevaux swayback hétérozygotes et trois (9 %) qui n'avaient pas du tout l'haplotype (tableau 4). Il peut y avoir de multiples causes de swayback chez les chevaux de selle, et le gène récessif suggéré par cette étude peut n'être que l'une d'entre elles. D'autres gènes, des accidents affectant l'intégrité squelettique ou encore des pratiques de gestion peuvent provoquer un swayback en l'absence du gène récessif impliqué par cette étude. Néanmoins, compte tenu de la forte prévalence de cet haplotype chez les chevaux atteints, cette maladie héréditaire récessive est probablement la cause la plus fréquente de swayback chez les chevaux de selle.

Comme indiqué ci-dessus, la région contient 53 gènes connus ou prédits pour le cheval. Nous avons sélectionné trois gènes pour le séquençage de l'ADN dans l'espoir d'identifier la mutation en cause. Un gène de cette région, RUNX2, avait été impliqué dans des défauts squelettiques sur la base des informations de l'OMIM. RUNX2 s'est avéré être un échafaudage pour les facteurs impliqués dans l'expression des gènes squelettiques (Stein et al. 2004), et il joue un rôle dans la différenciation et la migration des ostéoblastes et des chondrocytes (Fujita et al. 2004). À partir de l'évaluation d'autres fonctions génétiques probables, le gène candidat TRERF1 a été identifié sur la base de sa fonction en tant que facteur de transcription. CNPY3, un gène contenant des répétitions trinucléotidiques, a également été pris en compte, car il a été démontré que l'expansion des répétitions joue un rôle dans diverses maladies. Une telle expansion répétée au sein de SCA1 sur 6p humain est responsable de l'ataxie spinocérébelleuse de type 1 (Kameya et al. 1994). Cependant, le séquençage des exons des trois gènes candidats n'a pas identifié de SNP ou d'autres marqueurs génétiques associés au trait.

Rooney & Robertson (1996) distinguent la lordose sénile et la lordose congénitale chez les chevaux. La lordose sénile était une conséquence du vieillissement. La lordose congénitale est survenue à la suite d'une hypoplasie des facettes articulaires des vertèbres thoraciques. Accouchement consécutif à la mise en charge (Rooney & Pickett 1967). Nous pensons que la condition que nous avons étudiée chez les chevaux ASB est la forme congénitale, car la plupart des chevaux affectés avaient moins de 10 ans. Cependant, cela devrait être confirmé par une mesure séquentielle du MBC chez des chevaux d'âges différents, en se concentrant particulièrement sur jeunes chevaux, pour déterminer la progression de la lordose.

La découverte de la mutation responsable du swayback est un objectif qui nous attend. Dans le cadre de ce projet, les exons de plusieurs gènes candidats ont été séquencés. Cependant, la cause du trait pourrait être due à des aspects de l'expression des gènes qui ne sont pas codés dans les exons. À mesure que nous en apprenons davantage sur le génome des animaux, nous réalisons que même les introns et l'ADN entre les gènes peuvent jouer un rôle dans la régulation des gènes. La région d'intérêt pourrait être réduite par d'autres études utilisant des marqueurs génétiques supplémentaires de cette région, y compris plus de SNP, de microsatellites ou d'autres polymorphismes génétiques. Une autre approche pour comprendre cette condition peut être d'étudier les différences dans l'expression des gènes entre les chevaux affectés et non affectés. La découverte d'un gène qui montre une expression différentielle aiderait à orienter ce travail. Cependant, le choix des tissus et l'âge auquel les chevaux sont testés peuvent être des facteurs qui confondent une telle approche.

Une meilleure compréhension de la variation responsable de l'apparition précoce de la lordose extrême chez les chevaux peut être bénéfique pour les études de la cyphose juvénile humaine et de la scoliose juvénile idiopathique (SI). Comme chez le cheval, ces deux affections congénitales présentent un âge précoce d'apparition. La SI familiale ne représente que 10 % de tous les cas chez l'homme, tandis que 90 % semblent être sporadiques avec des facteurs étiologiques inconnus ou environnementaux (Cheng et al. 2007). Grâce à l'analyse de liaison familiale, des régions candidates à la susceptibilité à l'IS ont été identifiées sur les chromosomes humains 6p, 10q et 18q (Wise et al. 2000). Dans une étude plus récente, les régions 6, 9, 16 et 17 ont été identifiées par criblage à l'échelle du génome (Miller et al. 2005). Il est particulièrement intéressant de noter que le segment sur HSA6 impliqué dans cette étude est synténique avec la région sur ECA20 qui s'est avérée dans cette étude associée au swayback.