Il y aura beaucoup de chevaux qui

L'analyse d'association comparant les chevaux pur-sang qui ont remporté des courses Graded Stakes à une distance de 7 stades ou moins avec ceux qui ont remporté des courses Graded Stakes sur une distance de 8 à 10 stades a identifié un seul locus sur ECA18 qui a atteint une signification à l'échelle du génome après analyse de permutation.

Alors qu'un pic d'association clair impliquant un grand nombre de SNP vers l'extrémité distale de l'ECA18 est évident sur la figure 1c, seuls deux SNP, BIEC2-417274 (situés à 65 868 604 bp) et BIEC2-417495 (situés à 67 186 093 bp ), atteignent une signification à l'échelle du génome avec des valeurs −log 10 EMP2 de 1,3829 et 1,6345, respectivement. Lorsque les gènes de cette région de ECA18 ont été examinés à l'aide du navigateur génomique Ensembl, il a été noté que le gène MSTN (myostatine) est situé entre les deux SNP significatifs à 66 490 208-66 495 180 pb.

Traditionnellement, l'industrie du cheval pur-sang considérait les chevaux qui couraient sur moins de sept stades, entre sept et douze stades et plus de douze stades comme différents, les qualifiant respectivement de sprinters, de demi-fond et de stayers. Les pedigrees des chevaux qui courent sur ces différentes distances ont tendance à être différents. Les éleveurs ont souvent essayé de produire des chevaux de demi-fond en faisant passer des sprinters à des stayers. Les chevaux des différents groupes de distance possèdent également souvent des morphologies corporelles distinctes, les sprinteurs étant fortement musclés, tandis que les chevaux de demi-fond et restants ont une musculature plus légère. Cette différence phénotypique suggère que la myostatine pourrait jouer un rôle dans la préférence de distance des chevaux pur-sang.

L'augmentation de la musculature observée avec les mutations de la myostatine n'affecte pas tous les types de fibres musculaires de la même manière, et il existe une augmentation préférentielle des fibres glycolytiques rapides de type IIB (Deveaux et al.2001; Hennebry et al. 2009), ce qui est cohérent avec l'amélioration de la capacité de sprint.

L'identification de marqueurs SNP liés aux loci de myostatine associés à la capacité athlétique du cheval pur-sang représente le premier gène influençant la capacité athlétique identifié chez le cheval.

Alors que cet article était en préparation, Hill et al. (2010) ont publié des recherches montrant qu'un polymorphisme du gène de la myostatine est fortement associé à la meilleure distance de course chez les chevaux pur-sang d'élite. Dans leur étude, la myostatine a été sélectionnée comme gène candidat, et bien que la mutation intronique utilisée se trouve dans le gène de la myostatine, ils déclarent que les résultats n'excluent pas que la variante fonctionnelle soit dans un gène voisin. Ils déclarent qu'il n'y a pas d'autres candidats plausibles à moins de 2 Mb en amont ou en aval du gène de la myostatine, bien qu'il ne soit pas clair si la mutation fonctionnelle pourrait être plus éloignée que cela. De plus, ils ne semblent pas avoir contrôlé la possibilité d'une stratification de la population entre les populations de sprint et de séjour en testant l'association avec d'autres gènes peu susceptibles d'être impliqués dans la physiologie musculaire.

Dans cette étude, à la suite d'une stratégie d'analyse d'association à l'échelle du génome, nous identifions un seul locus sur ECA18 qui est significatif au niveau du génome après l'analyse de permutation. Dans notre analyse, la stratification de la population entre les sprinters et les chevaux de demi-fond est contrôlée en interne et exclue par les 54 600 SNP restants uniformément répartis dans le génome. Aucune autre région du génome n'a montré de différence statistiquement significative à l'échelle du génome, indiquant qu'il n'existe aucune stratification de la population.

Les résultats ont clairement des implications pour les industries des courses et de l'élevage de pur-sang, bien qu'il soit important de souligner que les marqueurs identifiés ne définissent en aucun cas la "classe" de course probable de l'individu, mais simplement sur quelle distance le cheval est susceptible d'être le plus efficace. Il serait faux d'assimiler directement la préférence pour les distances de sprint à la vitesse, et la myostatine ne représente pas « le gène de la vitesse ». Il y aura de nombreux chevaux qui, bien qu'homozygotes pour le génotype de sprint, sont de mauvais chevaux de course et seraient battus sur les distances de sprint par de meilleurs chevaux de course avec l'un des deux autres génotypes.